Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RetP35546 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RetP35546 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RetP35546 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms