Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6dP35459 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms