Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms