Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sftpa1P35242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms