Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mmp12P34960 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp12P34960 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms