Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rom1P32958 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rom1P32958 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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