Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc5P32043 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms