Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms