Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd28P31041 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd28P31041 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms