Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms