Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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