Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxraP28700 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxraP28700 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxraP28700 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxraP28700 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxraP28700 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxraP28700 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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