Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BgnP28653 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BgnP28653 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BgnP28653 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BgnP28653 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BgnP28653 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BgnP28653 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BgnP28653 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BgnP28653 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms