Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Hoxd9P28357 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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