Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms