Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms