Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChgaP26339 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms