Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd19P25918 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd19P25918 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms