Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou2f1P25425 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou2f1P25425 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms