Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd247P24161 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms