Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hoxd11P23813 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hoxd11P23813 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd11P23813 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd11P23813 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxd11P23813 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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Hoxd11P23813 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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