Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd8P23463 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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