Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcb1aP21447 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms