Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tpm3P21107 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms