Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcaP20444 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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