Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TP20293 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TP20293 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TP20293 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TP20293 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TP20293 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TP20293 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms