Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P20040 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P20040 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P20040 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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