Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms