Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Esr1P19785 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms