Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NelfeP19426 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms