Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms