Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spi1P17433 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spi1P17433 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms