Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f1P17208 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms