Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Q9P14431 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms