Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpsaP14206 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms