Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dnmt1P13864 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt1P13864 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms