Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx1P13297 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms