Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtcP11725 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtcP11725 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtcP11725 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtcP11725 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtcP11725 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtcP11725 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtcP11725 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OtcP11725 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OtcP11725 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms