Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DmdP11531 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DmdP11531 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DmdP11531 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DmdP11531 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DmdP11531 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DmdP11531 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DmdP11531 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DmdP11531 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms