Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fv4P11370 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms