Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spp1P10923 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spp1P10923 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms