Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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