Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms