Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Myod1P10085 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms