Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprqP0C5E4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms