Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtaP09225 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtaP09225 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtaP09225 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtaP09225 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtaP09225 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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