Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxb7P09024 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxb7P09024 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms