Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmcP08882 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GzmcP08882 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms