Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NefmP08553 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NefmP08553 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NefmP08553 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NefmP08553 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms