Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col4a2P08122 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms